在我國的歷史上，有過一段時間的“族內婚”階段，但是因此經受了很大的災難，所以我們可以找到不能同姓結婚的記載，比如說《左傳》：“男女同姓，其生不蕃。”《國語·晉語》裡也有記載：“同姓不婚，惡不殖也。”都是說明了同姓結婚的害處就是生下的孩子活不長久或者是多有疾病，因此在古代見得最多的就是姑表親和姨表親之間通婚，雖然也是近親，但是可供選擇的範圍就很廣了，而且也不能兩個家族世代通婚，這完全是為了家族的繁衍考慮。

不過和我國隔海相望的日本皇室可不這樣。日本皇室向來被傳說是日本的神族，沒有姓氏，也不受戶籍法律管理，而是有專門的一套《皇室典範》來規範他們的日常生活，而且日本皇室為了保持皇室血脈的純潔性，只會選擇皇室內部成員進行通婚。就是說能夠做皇后的女子只能是和天皇有親密關係的五個家族的姑娘，能做妃子的也不是一般家庭的女子，會受到門第的限制，所以日本皇室之間經常會近親結婚。

近親結婚的危害相信大家都有一個大概的瞭解，最大的危害就是會大大提高隱性遺傳病的機率，據分析，近親結婚的後代隱性遺傳病會是非近親結婚後代隱性遺傳病的150倍，並且近親結婚後代所患的先天性心臟病、無腦兒、脊髓裂變等多基因病的發病率約為1。64%，可以說一百個近親結婚的後代中就會出現1~2個有上述疾病的，並且近親結婚的後代體質很差，身高也比正常人矮，這也是日本皇室成員的身高都不怎麼高的原因。

可是即使這樣，日本皇室還是不放棄近親結婚，比如日本的第20代天皇木梨輕，他在繼承皇位之前，就愛上了和自己一母同胞的妹妹，不顧人倫關係就和她結了婚，甚至還說：“為了堅持皇室血脈的純粹。”

除此之外還有日本歷史上最著名的大正天皇，是日本的第123代天皇，生下來的時候身體與智力的發育就不太正常，後來長大了稍微好了一點，但是他根本就不能商議國策，在出席典禮的時候甚至拿著一張紙捲成紙筒當作望遠鏡，這讓日本皇室的形象嚴重受損，到了後期更是患上了嚴重的精神疾病。

他的兒子裕仁，昭和天皇也不例外，6歲的時候就被發現右手的手指不太靈活，還有這先天近視的毛病，這都是基因裡自帶的遺傳疾病，就算是透過醫療手段，也沒有任何效果，他到了老年時期更是患有十二指腸癌，這讓他的晚年非常痛苦。

而且因為近親結婚的原因，日本皇室從1965年到2006年之間都沒有男嬰誕生，但是日本皇室的女性並沒有繼承皇位的權利。據統計，日本歷史上一共出現了8位女天皇，但是在位期間都沒有生育子女，到了晚年的時候都是直接傳位給皇室的男性成員。而現在日本皇室只有一個小皇孫悠仁親王，實在是陰盛陽衰的組成，所以日本皇室有在考慮恢復納妾制度。