子蓮對水分要求特別嚴格，在整個生育期中不能斷水，否則節間縮短，嚴重時死亡，蓮田灌水原則是
“淺——深——淺”，即立葉抽生前灌
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～
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釐米的淺水，提高土溫促進種藕養分物質的轉化、抽鞭及立葉的生長。寒潮來臨時加深水層保溫，
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月中旬至
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月上旬，水層逐漸加深到
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釐米左右，有利於加快蓮鞭生長。走鞭分枝和地上部分花蕾健壯生長；
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月中旬至
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月底，生長進入高峰期，正處於烈日高溫，可灌
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釐米的流動深水，達到降溫保溼，花多蓬大，顆粒飽滿，提高結實率，採摘後期到翌年
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月，恢復淺灌水，有利於成藕和種藕的安全越冬，有條件的地方也可深灌水，預防白蓮腐敗病的發生。