玄武門之變正史寫得很簡單，主要就是秦王府集團在太子、齊王入宮路上設伏，成功斬殺二人，然後向唐高祖稟報，秦王順利取得太子地位，兩個月後秦王正式登基，是為唐太宗。這次政變的原因正史裡寫得比較簡單，主要是就是太子建成誣陷並且謀害秦王，導致秦王發動政變。

然而，對我國曆史稍有了解的人都知道，搞政變不是一件簡單的事。歷史上政變很多，大多數政變都歸於失敗，少數政變成功的成為書寫歷史的勝利者，也就是我們看到的歷史都是勝利者書寫的，而失敗者一定是“罄南山之竹，書罪未窮；決東海之波，流惡難盡”的，否則就無法彰顯勝利者的正義。玄武門之變當然也不例外，太子建成就完全成了一個十惡不赦之徒。然而，歷史畢竟是真實發生過的事實，勝利者並不能完全掩蓋，歷史還是給我們留下了蛛絲馬跡以供後人去還原事實。

首先要懷疑的問題就是正史所載的玄武門之變是不是就是真正的事實。根據《貞觀紀要》記載：貞觀十四年，太宗謂房玄齡曰：“朕每觀前代史書，彰善癉惡，足為將來規誡。不知自古當代國史，何因不令帝王親見之？” 經過十幾年時間，唐太宗在已經控制住局面的情況下，已經開始考慮要美化自己的形象了。雖然房玄齡婉拒，但還是抵不住皇帝的壓力，最終“玄齡等遂刪略國史為編年體，撰高祖、太宗實錄各二十卷，表上之”。唐太宗這一輩子最在意的汙點是什麼，當然就是“刪略”的重點物件。毫無疑問，弒兄殺弟，完全違背“孝悌之義”的玄武門是唐太宗心頭上的刺，毫無疑問，玄武門的正史基本情節上是沒有辦法掩蓋的，所以弒兄殺弟等情節是真實的，但是在這背後更嚴重的陰謀是一定被人為的刪改以及掩蓋過的。

第一點就是太子建成是唐高祖真正心儀的接班人。而且這一點一直都是明確的，也從未發生改變過的。從武德元年李淵稱帝開始，就直接立李建成為帝，到玄武門之變，他的太子地位一直都穩固的，李世民宣稱的李淵有意將皇位傳給他倒很像是給自己發動政變增加合法性的由頭。從政變之前李淵、李建成對李世民的態度來看，兩人都是比較顧念父子、兄弟之情的，當然，這也說明，李淵和李建成對於壓制住李世民擁有相當的優勢，無需用殘酷的肉體消滅就可以解決掉李世民，而玄武門之變前，抽調秦王府集團主要人員隨齊王出征就是很明顯的削弱秦王實力的政治手段，這一系列的手段背後，不光是李建成，還有李淵。所以，玄武門之變的目標就不僅僅是李建成、李元吉，直接目標當然還有李淵，否則就不會政變後僅僅兩個月，李淵就禪讓帝位了。

在玄武門之變進行當中，皇宮的禁軍始終沒有參與，這也是很蹊蹺的。這基本上可以說明秦王早就收買了守門的禁軍，而且多半已經在皇宮內控制了李淵。在成功擊殺太子、齊王后，李世民派尉遲敬德手執兵器去向李淵報告，此時李淵正泛舟海池。 這個情況本身就很怪異，這麼關鍵的時刻，正巧皇帝就在泛舟，遠離陸地，這一切都像是被提前軟禁的跡象。而且尉遲敬德全副武裝進禁宮去見皇帝，基本上就是赤祼祼的危脅了。這些情況基本上說明，玄武門之變是提前嚴密謀劃好的，政變目標直指李淵、李建成、李元吉三人的政變，並不是像史書裡寫的那樣看起來好似是被迫倉促反抗的冒險。