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自
CRISPR-Cas9
基因
編輯技術誕生以來,大家對其“
基因魔剪
”這個代稱印象過於深刻,以至於忽略了其同樣可以作為基因表達增強和基因表達降低的工具。
最早開發出CRISPR-dCas9,並將其應用到
基因表達增強
(CRISPRa)和
基因表達降低
(CRISPRi)的是斯坦福大學的
亓磊
,該技術可以在不導致DNA雙鏈斷裂的情況下,精準調控基因表達水平,這也大大擴充套件了CRISPR技術的應用範圍和潛力。
2021年6月24日,馬里蘭大學
戚益平
團隊在
Nature
子刊
Nature Plants
發表了題為:CRISPR–Act3。0 for highly efficient multiplexed gene activation in plants的研究論文。
該研究開發了名為CRISPR–Act3.0的基因編輯技術,能夠在植物中實現多重基因啟用。該系統的啟用能力是當前最先進的CRISPR啟用技術的四到六倍,並且可以一次啟用多大7個基因
。
啟用基因以獲得功能增益,對於創造更好的植物尤其是農作物具有重要意義。
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雖然之前已有研究將CRISPR啟用(CRISPRa)成功用於植物基因地啟用,但是一次啟用多個基因仍然存在挑戰,而啟用基因表達以獲得功能增益,對於創造更好的植物尤其是農作物具有重要意義。
為了實現這一目標,研究團隊在植物中引入了一種新的改進CRISPR系統,並命名為:
CRISPR–Act 3.0
。這一第三代CRISPR系統專注於多重基因啟用,可以同時增強多個基因的功能。
戚益平
團隊之前開發植物中的多重基因編輯技術,透過敲除多個基因改進作物,但是這種策略潛力有限,因為並沒有多少基因能夠透過降低表達來實現作物的改進。
而增強就不一樣了,可以透過增強基因表達,甚至增加新的基因,來提高我們想要的功能。
對於CRISPRa,是基於切割活性喪失的dCas9結合多種轉錄啟用因子,在嚮導RNA(gRNA)實現的,gRNA引導dCas9和轉錄因子結合在特定的DNA序列,從而啟用基因表達。由於dCas9的DNA切割活性喪失,因此不會造成DNA雙鏈斷裂,因此具有更高的安全性。
第一代CRISPRa系統基於
dCas9-VP64
,第二代CRISPRa系統包括
dCas9-SunTag
等,第二代系統能夠串聯多個VP64,實現更高水平的基因啟用。
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在這項研究中,研究團隊開發的
CRISPR–Act 3.0
,dSpCas9與VP64融合,其偶聯的gR2。0包含兩個MS2 RNA適體,用於招募更多與SunTag融合的MS2噬菌體外殼蛋白(MCP)。
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研究人員在
水稻
、
西紅柿
和
擬南芥
中驗證了
CRISPR-Act 3.0
系統的效果。試驗結果表明,
CRISPR-Act 3.0
可以同時啟用多種基因,包括
加快開花速度
以
加快育種過程
的基因。
此外,為了靶向富含T的PAM序列,研究團隊還CRISPR-Act 3。0應用到了
Cas12b
,研究團隊還開發了基於
SpRY
變體的不依賴PAM序列的CRISPR-Act3。0系統,這些在啟用效力和靶向範圍方面均優於dCas9-NG系統。
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總的來說,該研究開發了一個簡介的多重基因啟用的策略,無論在效果上,還是效率上,都遠超目前的CRISPR啟用技術。這一技術對於設計、定製、創造更優秀的作物具有重要應用價值,也有助於應對氣候變化和全球飢餓。